Person: Seminario Huárriz, Amaia
Loading...
Email Address
person.page.identifierURI
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
Seminario Huárriz
First Name
Amaia
person.page.departamento
Ciencias del Medio Natural
person.page.instituteName
ORCID
person.page.upna
810891
Name
5 results
Search Results
Now showing 1 - 5 of 5
Publication Open Access Drought stress responses in Medicago truncatula and Glycine max: system biology approaches(2017) Seminario Huárriz, Amaia; González García, Esther; Larrainzar Rodríguez, Estíbaliz; Ciencias del Medio Natural; Natura Ingurunearen ZientziakLas leguminosas, después de los cereales, son el cultivo de mayor importancia económica a nivel mundial. Sin embargo, estas plantas son muy sensibles a los estreses abióticos, siendo la sequía el que más afecta a su producción. El objetivo general del presente trabajo es ampliar los conocimientos sobre las respuestas a sequía de la parte aérea y la raíz de dos especies de leguminosas (Medicago truncatula y Glycine max) mediante la combinación de enfoques fisiológicos, morfológicos, transcriptómicos y metabolómicos. El ácido ascórbico (AsA) es uno de los antioxidantes más abundantes en los tejidos vegetales que está involucrado en mecanismos enzimáticos y no enzimáticos de desintoxicación celular. Sin embargo, poco se sabe sobre la regulación de su biosíntesis bajo situaciones de estrés por sequía. En el capítulo 1 de este estudio, a través de una combinación de enfoques moleculares y fisiológicos, se observó que la biosíntesis del AsA está gravemente afectada por la sequía. Estos análisis mostraron que en plantas de soja sometidas a condiciones de estrés hídrico existen múltiples puntos de control que regulan la biosíntesis de AsA a nivel de la GDP-D-manosa pirofosforilasa y de la GDP-D-manosa 3 ', 5'-epimerasa. Estas respuestas también se observaron en la leguminosa modelo M. truncatula. En el segundo capítulo de este trabajo se muestra el estrecho vínculo existente entre la parte aérea y la raíz de plantas de M. truncatula. Así, bajo condiciones de sequía, las plantas adultas priorizaron el crecimiento de las raíces frente al desarrollo foliar. Los diferentes análisis mostraron respuestas que sugieren una estrategia de supervivencia pasiva para las hojas coexistentes con un compromiso activo de la raíz en las plantas afectadas por la sequía. Existe la necesidad de desarrollar nuevos protocolos no destructivos y no tóxicos que simulen condiciones de sequía para caracterizar mejor las respuestas de las plantas bajo condiciones controladas. En el capítulo 3 se presenta un nuevo método simple, eficiente y reproducible para simular condiciones in vitro de estrés por sequía en plántulas de M. truncatula crecidas en diferentes concentraciones de agar. Después de validar el uso de este método, se observó que las raíces desempeñan un papel clave en la adaptación de la planta a estas condiciones de estrés. La simplicidad de este método permite el análisis de poblaciones a gran escala para identificar rasgos de resistencia a la sequía en una variedad de plantas. Por último, en el capítulo 4, el método descrito en el capítulo anterior fue aplicado en combinación con análisis fisiológicos, transcriptómicos y metabolómicos al análisis de la zona de absorción de la raíz responsable de la absorción de agua y nutrientes para el crecimiento de la planta. Los resultados indicaron que las plantas mostraron rápidas respuestas moleculares bajo condiciones de sequía; el metabolismo de lípidos, hormonas, la composición de la pared celular y el metabolismo secundario se vieron muy afectados permitiendo a las plantas hacer frente a situaciones de estrés por sequía. En resumen, este trabajo proporciona nuevas perspectivas en la comprensión de las respuestas de las leguminosas a las condiciones de limitación de agua y contribuye a aclarar las señales de estrés hídrico y las redes de genes que controlan la respuesta de las plantas leguminosas a la sequía.Publication Open Access Local inhibition of nitrogen fixation and nodule metabolism in drought-stressed soybean(Oxford University Press, 2013) Gil Quintana, Erena; Larrainzar Rodríguez, Estíbaliz; Seminario Huárriz, Amaia; Díaz Leal, Juan Luis; Alamillo, Josefa M.; Pineda, Manuel; Arrese-Igor Sánchez, César; Wienkoop, Stefanie; González García, Esther; Ciencias del Medio Natural; Natura Ingurunearen Zientziak; Universidad Pública de Navarra / Nafarroako Unibertsitate Publikoa: 735/2008; Universidad Pública de Navarra / Nafarroako Unibertsitate Publikoa: 134/2012Drought stress is a major factor limiting symbiotic nitrogen fixation (NF) in soybean crop production. However, the regulatory mechanisms involved in this inhibition are still controversial. Soybean plants were symbiotically grown in a split-root system (SRS), which allowed for half of the root system to be irrigated at field capacity while the other half remained water deprived. NF declined in the water-deprived root system while nitrogenase activity was maintained at control values in the well-watered half. Concomitantly, amino acids and ureides accumulated in the water-deprived belowground organs regardless of transpiration rates. Ureide accumulation was found to be related to the decline in their degradation activities rather than increased biosynthesis. Finally, proteomic analysis suggests that plant carbon metabolism, protein synthesis, amino acid metabolism, and cell growth are among the processes most altered in soybean nodules under drought stress. Results presented here support the hypothesis of a local regulation of NF taking place in soybean and downplay the role of ureides in the inhibition of NFPublication Open Access Nodule carbohydrate catabolism is enhanced in the Medicago truncatula A17-Sinorhizobium medicae WSM419 symbiosis(Frontiers Media, 2014) Larrainzar Rodríguez, Estíbaliz; Gil Quintana, Erena; Seminario Huárriz, Amaia; Arrese-Igor Sánchez, César; González García, Esther; Ciencias del Medio Natural; Natura Ingurunearen Zientziak; Universidad Pública de Navarra / Nafarroako Unibertsitate PublikoaThe symbiotic association between Medicago truncatula and Sinorhizobium meliloti is a well-established model system in the legume–Rhizobium community. Despite its wide use, the symbiotic efficiency of this model has been recently questioned and an alternative microsymbiont, S. medicae, has been proposed. However, little is known about the physiological mechanisms behind the higher symbiotic efficiency of S. medicae WSM419. In the present study, we inoculated M. truncatula Jemalong A17 with either S. medicae WSM419 or S. meliloti 2011 and compared plant growth, photosynthesis, N2-fixation rates, and plant nodule carbon and nitrogen metabolic activities in the two systems. M. truncatula plants in symbiosis with S. medicae showed increased biomass and photosynthesis rates per plant. Plants grown in symbiosis with S. medicae WSM419 also showed higher N2-fixation rates, which were correlated with a larger nodule biomass, while nodule number was similar in both systems. In terms of plant nodule metabolism, M. truncatula–S. medicae WSM419 nodules showed increased sucrose-catabolic activity, mostly associated with sucrose synthase, accompanied by a reduced starch content, whereas nitrogen-assimilation activities were comparable to those measured in nodules infected with S. meliloti 2011. Taken together, these results suggest that S. medicae WSM419 is able to enhance plant carbon catabolism in M. truncatula nodules, which allows for the maintaining of high symbiotic N2-fixation rates, better growth and improved general plant performance.Publication Open Access Photosynthetic metabolism under stressful growth conditions as a bases for crop breeding and yield improvement(MDPI, 2020) Morales Iribas, Fermín; Ancín Rípodas, María; Fakhet, Dorra; González Torralba, Jon; Gámez Guzmán, Angie Lorena; Seminario Huárriz, Amaia; Soba Hidalgo, David; Ben Mariem, Sinda; Garriga, Miguel; Aranjuelo Michelena, Iker; Agronomia, Bioteknologia eta Elikadura; Institute for Multidisciplinary Research in Applied Biology - IMAB; Agronomía, Biotecnología y AlimentaciónIncreased periods of water shortage and higher temperatures, together with a reduction in nutrient availability, have been proposed as major factors that negatively impact plant development. Photosynthetic CO2 assimilation is the basis of crop production for animal and human food, and for this reason, it has been selected as a primary target for crop phenotyping/breeding studies. Within this context, knowledge of the mechanisms involved in the response and acclimation of photosynthetic CO2 assimilation to multiple changing environmental conditions (including nutrients, water availability, and rising temperature) is a matter of great concern for the understanding of plant behavior under stress conditions, and for the development of new strategies and tools for enhancing plant growth in the future. The current review aims to analyze, from a multi-perspective approach (ranging across breeding, gas exchange, genomics, etc.) the impact of changing environmental conditions on the performance of the photosynthetic apparatus and, consequently, plant growth.Publication Open Access Drought stress causes a reduction in the biosynthesis of ascorbic acid in soybean plants(Frontiers Media, 2017) Seminario Huárriz, Amaia; Song, Li; Zulet González, Amaia; Nguyen, Henry T.; González García, Esther; Larrainzar Rodríguez, Estíbaliz; Ciencias del Medio Natural; Natura Ingurunearen Zientziak; Gobierno de Navarra / Nafarroako Gobernua, 2016/PI013; Universidad Pública de Navarra / Nafarroako Unibertsitate Publikoa, 1287/2011Drought provokes a number of physiological changes in plants including oxidative damage. Ascorbic acid (AsA), also known as vitamin C, is one of the most abundant water-soluble antioxidant compound present in plant tissues. However, little is known on the regulation of AsA biosynthesis under drought stress conditions. In the current work we analyze the effects of water deficit on the biosynthesis of AsA by measuring its content, in vivo biosynthesis and the expression level of genes in the Smirnoff-Wheeler pathway in one of the major legume crop, soybean (Glycine max L. Merr). Since the pathway has not been described in legumes, we first searched for the putative orthologous genes in the soybean genome. We observed a significant genetic redundancy, with multiple genes encoding each step in the pathway. Based on RNA-seq analysis, expression of the complete pathway was detected not only in leaves but also in root tissue. Putative paralogous genes presented differential expression patterns in response to drought, suggesting the existence of functional specialization mechanisms. We found a correlation between the levels of AsA and GalLDH biosynthetic rates in leaves of drought-stressed soybean plants. However, the levels of GalLDH transcripts did not show significant differences under water deficit conditions. Among the other known regulators of the pathway, only the expression of VTC1 genes correlated with the observed decline in AsA in leaves.