Alfonso Ruiz, Leopoldo

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Alfonso Ruiz

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Leopoldo

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Agronomía, Biotecnología y Alimentación

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IS-FOOD. Research Institute on Innovation & Sustainable Development in Food Chain

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  • PublicationOpen Access
    Textile characteristics of fiber from Huacaya alpacas (Vicugna pacos)
    (Universidad Nacional de Trujillo (Perú). Facultad de Ciencias Agropecuarias, 2019) Paucar Chanca, Rufino; Alfonso Ruiz, Leopoldo; Soret Lafraya, Beatriz; Mendoza Ordóñez, G.; Alvarado Quezada, F.; Agronomía, Biotecnología y Alimentación; Agronomia, Bioteknologia eta Elikadura
    Fiber from alpacas represents a substantial component of economic output for South American countries. In this study it determined the textile characteristics of fibers obtained from Huacaya alpacas raised at the South American Camelids Research and Development Center-Lachocc (CRDC-Lachocc) located at The National University of Huancavelica (UNH). Fleece samples were obtained from the mid-side rib area of 74 white alpacas (42 females and 32 males) of varying ages. The Average Fiber Diameter (AFD), Standard Deviation of the Average Fiber Diameter (SDAFD), Fiber Diameter Coefficient of Variation (FDCV), Comfort Factor (CF) and Staple Length (SL) were measured as textile characteristics and related to sex and age group. Most of the fleece samples could be classified as baby alpaca fleece according to the Peruvian Technical Standard classification (231.301.2014). Sex had no influence on any textile characteristic (p > 0.05). Meanwhile, age affected only AFD and CF (p < 0.05). Together the results indicated that alpacas farmed at CRDC-Lachocc had good potential to produce high quality fibers.
  • PublicationOpen Access
    The effects of selective breeding against scrapie susceptibility on the genetic variability of the latxa black-faced sheep breed
    (EDP Sciences, 2006) Alfonso Ruiz, Leopoldo; Parada Rey, Analia; Legarra, Andrés; Ugarte, Eva; Arana Navarro, Ana; Producción Agraria; Nekazaritza Ekoizpena
    Breeding sheep populations for scrapie resistance could result in a loss of genetic variability. In this study, the effect on genetic variability of selection for increasing the ARR allele frequency was estimated in the Latxa breed. Two sources of information were used, pedigree and genetic polymorphisms (fifteen microsatellites). The results based on the genealogical information were conditioned by a low pedigree completeness level that revealed the interest of also using the information provided by the molecular markers. The overall results suggest that no great negative effect on genetic variability can be expected in the short time in the population analysed by selection of only ARR/ARR males. The estimated average relationship of ARR/ARR males with reproductive females was similar to that of all available males whatever its genotype: 0.010 vs. 0.012 for a genealogical relationship and 0.257 vs. 0.296 for molecular coancestry, respectively. However, selection of only ARR/ARR males implied important losses in founder animals (87 percent) and low frequency alleles (30 percent) in the ram population. The evaluation of mild selection strategies against scrapie susceptibility based on the use of some ARR heterozygous males was difficult because the genetic relationships estimated among animals differed when pedigree or molecular information was used, and the use of more molecular markers should be evaluated.
  • PublicationOpen Access
    Ayuda a las decisiones de apareamiento en poblaciones animales con información genealógica incompleta
    (Asociación Interprofesional para el Desarrollo Agrario, 2018) Alfonso Ruiz, Leopoldo; Institute on Innovation and Sustainable Development in Food Chain - ISFOOD
    Los coeficientes de parentesco y de relación media de parentesco son dos herramientas útiles para determinar apareamientos con el objetivo de controlar, de forma práctica, el aumento de la consanguinidad en poblaciones animales. No obstante, su utilidad se ve condicionada por la cantidad de información genealógica disponible, pues ésta determina, en ausencia de información genómica, la precisión con que podemos estimarlos. Cuando la información genealógica sea incompleta, afectando de forma distinta a los animales, la precisión de las estimaciones de los coeficientes variará entre animales, comprometiendo el resultado de las decisiones de apareamiento. El objetivo del trabajo es calcular algunas medidas de la fiabilidad de la estimación de los coeficientes de parentesco y de relación media de parentesco. Se plantea la utilización de dos medidas basadas en la proporción de antecesores conocidos en las cinco generaciones anteriores de un animal y en la incorporación de información conocida, pero no contenida en la genealogía, a través del concepto de grupos genéticos. Los resultados muestran que estas medidas pueden ayudar a mejorar las decisiones de elección de reproductores y de acoplamiento.
  • PublicationOpen Access
    Análisis de la relación entre el espesor de la grasa dorsal y el tamaño de los adipocitos en cerdas reproductoras
    (Asociación Interprofesional para el Desarrollo Agrario, 2007) Mendizábal Aizpuru, José Antonio; Abadía Durán, Silvia; Abaurrea Aramburu, Eneko; Alfonso Ruiz, Leopoldo; Producción Agraria; Nekazaritza Ekoizpena
    La correcta gestión de las reservas grasas durante el ciclo productivo de las cerdas reproductoras es un factor clave para la obtención de unos buenos resultados productivos. El principal depósito graso en las cerdas lo constituye el tejido graso subcutáneo, por lo que la medición del espesor graso dorsal es un buen indicador del estado de las reservas corporales. Aunque existen diversos puntos para la medición del espesor, se recomienda hacerlo a nivel de la última costilla flotante, punto que se conoce como P2 (Quiniou, 2004). En esta localización se pueden distinguir hasta tres capas distintas de grasa subcutánea (Moody y Zobrisky, 1966). Distintos trabajos han observado un desarrollo diferencial de las tres capas durante el crecimiento de los animales (Alfonso, 2004; Fortin, 1986), así como diferencias en su actividad lipogénica (Cámara et al., 1996). Por tanto, el estudio de las características de cada capa considerada como distinto depósito graso puede ser importante para conocer los mecanismos de acumulación y movilización de las reservas grasas. En este sentido, en el presente trabajo se estudia la relación entre el espesor de la grasa y el tamaño de los adipocitos de cada una de las capas descritas en la grasa subcutánea dorsal.
  • PublicationOpen Access
    An expression of mixed animal model equations to account for different means and variances in the base population
    (Editions Scientifiques Medicales Elsevier, 1999) Alfonso Ruiz, Leopoldo; Estany Illa, Joan; Producción Agraria; Nekazaritza Ekoizpena
    This paper presents a general expression to predict breeding values using animal models when the base population is selected, i.e. the means and variances of breeding values in the base generation differ among individuals. Rules for forming the mixed model equations are also presented. A numerical example illustrates the procedure.
  • PublicationOpen Access
    Impact of incorporating greenhouse gas emission intensities in selection indexes for sow productivity traits
    (Elsevier, 2019) Alfonso Ruiz, Leopoldo; Institute on Innovation and Sustainable Development in Food Chain - ISFOOD
    Genetic improvement programmes should incorporate emerging challenges about environmental concerns into breeding goals. The large volume of pig meat production implies important greenhouse gas (GHG) emissions despite its lower carbon footprint per animal in front of ruminant productions. The different breeding goals considered by swine industry depending on different purebred lines, or line crosses adapted to different market demands and production constraints, could mask the effect of incorporating GHG emissions into selection indexes for improving sow productivity traits in nucleus populations. This paper analysed this effect following a methodological approach consisting in augmenting existing selection indexes derived from profit functions. An index previously described in the literature including litter size at birth, piglet perinatal survival, piglet survival to weaning, age at first conception and weaning to conception interval, was employed. This index was expanded to include GHG emissions calculating the emission intensities per litter, assuming a finished pig market and different scenarios and financial costs of GHG emissions. Results indicated that the inclusion of GHG emissions diminished the economic weight of litter size and piglet survival vs. the age at first conception and the interval weaning to conception, but did not affect significantly the contributions of these traits in the selection indexes. The improvement of sow productivity traits diluted relevantly the GHG emissions per piglet produced, and so, per kg of pork produced. The approach used in this study, despite its limitations in front of bio-economic models, has shown to be a simple and flexible way to analyse the effect of incorporating GHG emissions into existing selection indexes.
  • PublicationOpen Access
    Comparative description of growth, fat deposition, carcass and meat quality characteristics of Basque and Large White pigs
    (EDP Sciences, 2005) Alfonso Ruiz, Leopoldo; Mourot, Jacques; Insausti Barrenetxea, Kizkitza; Mendizábal Aizpuru, José Antonio; Arana Navarro, Ana; Producción Agraria; Nekazaritza Ekoizpena; Gobierno de Navarra / Nafarroako Gobernua
    Characteristics of growth, fat deposition, carcass and meat quality of pigs from the Basque Black Pied breed were described and compared with those of Large White pigs. Four pens, two per breed, of eleven pigs born during the same two week period, were simultaneously fattened and slaughtered, under the same conditions. The experiment was carried out over a fixed duration (124 days) and slaughter was carried out at a fixed average age (202 days). Basque pigs showed lower growth and feed efficiency and higher backfat depth (2.6 vs. 1.7 cm, P < 0.001) than Large White pigs. The difference was especially noticeable in the middle subcutaneous fat layer (0.5 cm, P < 0.001). The meat of Basque pigs was darker, redder, more marbled, and with higher pH values than in Large White pigs. Differences in fatty acid composition were observed between breeds but they were not statistically significant (P > 0.05) because of high variability observed between animals. The Basque breed exhibited an early and higher adipose development and a higher activity of enzymes responsible for lipid synthesis than the Large White. The diameter of intramuscular adipose cells was larger in Basque (40.2 vs. 33.0 μm, P < 0.001) than in Large White pigs. The results show the particular characteristics of the Basque breed as compared to pig lines highly selected for lean growth efficiency.
  • PublicationOpen Access
    Conversión de las explotaciones de vacuno de leche a la producción de leche A2 ante una posible demanda del mercado: posibilidades e implicaciones
    (Asociación Interprofesional para el Desarrollo Agrario, 2019) Alfonso Ruiz, Leopoldo; Urrutia Vera, Olaia; Mendizábal Aizpuru, José Antonio; Institute on Innovation and Sustainable Development in Food Chain - ISFOOD
    El mercado de la leche de vaca, tras la desaparición de las cuotas lácteas, está provocando una importante restructuración en el sector. Una de las alternativas que están desarrollando, fundamentalmente las pequeñas explotaciones familiares, es la diferenciación de sus productos. En ese contexto, ha aparecido un tipo diferenciado de leche conocida como leche A2. Esta se caracteriza por estar libre de la variante A1 de la proteína β-caseína que, debido a una mayor producción de β-casomorfina-7 tras la digestión, puede dar lugar a intolerancias y afecciones gastrointestinales. En este trabajo se analizan las posibilidades e implicaciones de una selección a favor de la β-caseína A2 en el caso concreto de las explotaciones familiares de Guipúzcoa. Los resultados obtenidos a partir de 1868 hembras genotipadas muestran que la frecuencia del alelo que codifica la proteína A2 es 0,55, y no se han encontrado asociaciones desfavorables entre el alelo A2 y el valor genético para caracteres productivos, funcionales y morfológicos, ni con otros genes ni haplotipos. Bajo esta situación de partida, y empleando exclusivamente toros A2A2, la utilización o no de semen sexado, junto con las diferentes ratios de reposición que se apliquen, determinarán el periodo y el coste económico de la conversión de los rebaños a la producción de leche A2. En un escenario de costes razonables esta se estima entre los 8 y los 15 años, pudiendo llegar a suponer a una explotación de 150 vacas unos costes de unos 6.000 y 1.000 €/año, respectivamente.
  • PublicationOpen Access
    Molecular traceability of beef from synthetic Mexican bovine breeds
    (FUNPEC-RP, 2011) Rodríguez Ramírez, R.; Arana Navarro, Ana; Alfonso Ruiz, Leopoldo; González Córdova, A. F.; Torrescano, G.; Guerrero Legarreta, I.; Vallejo Córdoba, B.; Producción Agraria; Nekazaritza Ekoizpena
    Traceability ensures a link between carcass, quarters or cuts of beef and the individual animal or the group of animals from which they are derived. Meat traceability is an essential tool for successful identification and recall of contaminated products from the market during a food crisis. Meat traceability is also extremely important for protection and value enhancement of good-quality brands. Molecular meat traceability would allow verification of conventional methods used for beef tracing in synthetic Mexican bovine breeds. We evaluated a set of 11 microsatellites for their ability to identify animals belonging to these synthetic breeds, Brangus and Charolais/Brahman (78 animals). Seven microsatellite markers allowed sample discrimination with a match probability, defined as the probability of finding two individuals sharing by chance the same genotypic profile, of 10-8. The practical application of the marker set was evaluated by testing eight samples from carcasses and pieces of meat at the slaughterhouse and at the point of sale. The DNA profiles of the two samples obtained at these two different points in the productioncommercialization chain always proved that they came from the same animal.
  • PublicationOpen Access
    Mipob: un programa de simulación para el aprendizaje en mejora genética animal
    (Universidad de Córdoba, 2014) Alfonso Ruiz, Leopoldo; Producción Agraria; Nekazaritza Ekoizpena
    Se ha desarrollado un programa de simulación de apoyo a la docencia de los cursos introductorios a la Mejora genética animal. El programa surgió ante la ausencia de este tipo de herramientas docentes orientadas a estudiantes de primeros cursos de grado universitario, especialmente en lengua española. El programa simula una población animal cerrada de censo reducido en la que los estudiantes deben de ir tomando las decisiones de elección de futuros reproductores y cómo aparearlos. De esta forma se facilita la introducción de los conceptos básicos sobre selección y evaluación genética, y conservación y genética de poblaciones. El programa considera el caso particular del vacuno de carne y se pueden realizar hasta un total de diez generaciones de selección. Tras haber sido probado durante dos cursos consecutivos en enseñanza reglada universitaria, está disponible de forma gratuita para su libre utilización y distribución.