Aplicación en oncohematología de la tecnología de secuenciación de 3ª generación: MinION. ¿Podría sustituir a la secuenciación Sanger?

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dc.contributor.advisorTFESánchez Villegas, María Almudena
dc.contributor.advisorTFECalasanz Abinzano, María Josefa
dc.contributor.affiliationFacultad de Ciencias de la Saludes_ES
dc.contributor.affiliationOsasun Zientzien Fakultateaeu
dc.contributor.authorLuri Martín, Pablo
dc.date.accessioned2024-07-05T08:25:17Z
dc.date.issued2024
dc.date.updated2024-07-04T12:32:31Z
dc.description.abstractLa tecnología de MinION, secuenciador de 3º generación desarrollado por la empresa británica Oxford Nanopore Technologies (ONT), ha supuesto una revolución en el ámbito de la Secuenciación de Nueva Generación (Next Generation Sequencing por sus siglas en inglés, NGS). De tamaño sorprendentemente pequeño, este secuenciador ha sido desarrollado para lograr una secuenciación de secuencia larga que venga a solucionar los problemas derivados de la NGS utilizada actualmente, cuya limitación principal es precisamente el tamaño del fragmento secuenciado. Es una tecnología que va a permitir reducir los altos costes económicos de los fungibles que las técnicas actuales de NGS conllevan. La tecnología de secuenciación que caracteriza al MinION se basa en una secuenciación mediante nanoporos donde las hebras de DNA alcanzan estos nanoporos y, por complementariedad de bases, se adhieren a éstos y se secuencian. Los nucleótidos que se incorporan en la secuenciación provocan cambios en la corriente eléctrica y permiten su identificación individual. Desde su lanzamiento en 2014, la tecnología de MinION se ha aplicado principalmente en la secuenciación de virus (incluido la COVID-19), bacterias, levaduras, etc. Sin embargo, se le ha dado escasa utilidad en el campo de la oncohematología. La versatilidad de esta plataforma radica en que es capaz de leer secuencias largas, pero también secuencias cortas. Así pues, nos hemos focalizado en la aplicación de MinION en secuenciación de hebra corta (<700bp) como una tecnología más eficiente que podría sustituir al gold standard actual, que es la Secuenciación Sanger.es_ES
dc.description.abstractThe MinION technology, a 3rd generation sequencer developed by the British company Oxford Nanopore Technologies (ONT), has been a revolution in the field of Next Generation Sequencing (NGS). Surprisingly small in size, this sequencer has been developed to achieve long-sequence sequencing that solves the problems derived from the NGS currently used, whose main limitation is precisely the size of the sequenced fragment. It is a technology that will make it possible to reduce the high cost of consumables that current NGS techniques entail. The sequencing technology that characterises the MinION is based on sequencing using nanopores where the DNA strands reach these nanopores and, by base complementarity, adhere to them and are sequenced. The nucleotides that are incorporated into the sequencing cause changes in the electrical current and allow for individual identification. Since its launch in 2014, MinION's technology has been mainly applied in the sequencing of viruses (including COVID-19), bacteria, yeasts, etc. However, it has been of little use in the field of oncohaematology. The versatility of this platform lies in the fact that it is able to read long sequences, but also short sequences. Therefore, we have focused on the application of MinION in short strand sequencing (<700bp) as a more efficient technology that could replace the current gold standard, which is Sanger sequencing.en
dc.description.degreeMáster Universitario en Investigación en Ciencias de la Saludes_ES
dc.description.degreeUnibertsitate Masterra Osasun Zientzietako Ikerketaneu
dc.embargo.inicio2024-07-05
dc.embargo.lift2026-06-01
dc.embargo.terms2026-06-01
dc.format.mimetypeapplication/pdfen
dc.identifier.urihttps://academica-e.unavarra.es/handle/2454/50281
dc.language.isospa
dc.rights.accessRightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.subjectTecnología MinIONes_ES
dc.subjectDispositivo MinION de Oxford Nanoporees_ES
dc.subjectSecuenciación Sangeres_ES
dc.subjectNanoporoses_ES
dc.subjectOncohematologíaes_ES
dc.subjectDiagnóstico genéticoes_ES
dc.subjectVarianteses_ES
dc.subjectGeneses_ES
dc.subjectMinION technologyen
dc.subjectOxford Nanopore MinION deviceen
dc.subjectSanger sequencingen
dc.subjectNanoporesen
dc.subjectGenetic diagnosisen
dc.subjectVariantsen
dc.subjectGenesen
dc.titleAplicación en oncohematología de la tecnología de secuenciación de 3ª generación: MinION. ¿Podría sustituir a la secuenciación Sanger?es_ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dspace.entity.typePublication
relation.isAdvisorTFEOfPublicationae8afd07-1f10-4da5-8582-93b90a18aa88
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