Segmentación de células en imágenes KI67

Abstract

La segmentación es un tratamiento digital de imágenes que consiste en la división de una imagen en diferentes zonas, basándose en procedimientos de etiquetado deterministas o estocásticos (pertenecientes o relativos al azar) de contornos y/o regiones de la imagen, y utilizando información de la intensidad y/o información espacial. El objetivo principal de este proyecto fin de carrera es obtener imágenes segmentadas aparte de imágenes de células en color mediante diferentes algoritmos y métodos, con el fin de poder realizar un estudio comparativo según su efectividad y eficiencia basándose en el recuento de células en las imágenes. Después, a partir de estas imágenes segmentadas se pretende obtener el número de células marcadas por la proteína KI67. El estudio y pruebas realizadas en este documento están realizados en MATLAB, así como los algoritmos y métodos utilizados para ello. Se podría resumir en los siguientes pasos: se segmentan seis imágenes en color de células marcadas con la proteína KI67. La segmentación se realiza sobre cada imagen independientemente en un número determinado de zonas (2, 3, 4…), obteniendo de esta forma nuevas imágenes. Posteriormente servirán para hacer estudios y cálculos para estimar el número de células en cada imagen. Después estimaremos el número de células reales, es decir, las que se obtienen tras un recuento manual. Finalmente se comparan los resultados obtenidos basándose en su eficiencia y eficacia y también dependiendo de la forma de representación de las imágenes, es decir, el modelo de representación (RGB, HSV…).