Detección de diferentes especies de atún (género Thunnus) de alto valor comercial en conservas y en productos frescos

View/ Open
Date
2017Author
Advisor
Version
Acceso abierto / Sarbide irekia
Type
Trabajo Fin de Grado/Gradu Amaierako Lana
Impact
|
nodoi-noplumx
|
Abstract
En la venta de atún uno de los fraudes más comunes es la sustitución de especies de alta calidad
y elevado valor económico por otras distintas a las especificadas en la etiqueta. Por ello, el
objetivo del trabajo fue poner a punto una metodología rápida, sencilla y de elevada especificad
para la detección de especies de atún (Thunnus) basada en el ADN.
Se ensayaron distintos métodos de extrac ...
[++]
En la venta de atún uno de los fraudes más comunes es la sustitución de especies de alta calidad
y elevado valor económico por otras distintas a las especificadas en la etiqueta. Por ello, el
objetivo del trabajo fue poner a punto una metodología rápida, sencilla y de elevada especificad
para la detección de especies de atún (Thunnus) basada en el ADN.
Se ensayaron distintos métodos de extracción de ADN. Atendiendo a la cantidad y calidad de la
muestra, los mejores resultados se obtuvieron con un kit comercial (Wizard-DNA Clean-Up),
tanto para muestras de productos en fresco (T.alalunga, T.albacares y T.obesus) como en
conserva (T. albacares y T.alalunga).
Para identificar ausencia/presencia de ADN de las especies seleccionadas y cuantificar la cantidad
del mismo, se seleccionaron cebadores que permitieran amplificar secuencias de los genes 16S
rDNA, para la detección del género Thunnus, y secuencias específicas de la región control
mitocondrial de T.alalunga y T.albacares. Se realizaron ensayos para poner a punto las técnicas
de PCR cualitativa y cuantitativa, empleando en el segundo caso fluorocromos inespecíficos
(Sybr Green) y sondas específicas (TaqMan). Los resultados mostraron una amplificación
positiva con la PCR cualitativa para los tres fragmentos, permitiendo determinar la presencia de
este género y especies. Respecto a la PCR cuantitativa, se obtuvo una correcta amplificación para
el género Thunnus y T.alalunga por medio de fluorocromos inespecíficos, aunque no se logró con
T.albacares. Además, se ha puesto a punto la técnica para cuantificar el fragmento 16S rDNA
empleando sondas TaqMan, alcanzando una mayor especificidad. [--]
One of most common frauds in the sale of tuna is the replacement of the species specified on the
label with others of lower quality and value. Therefore, the purpose of the present work was to
develop a fast, sensible and highly specificity DNA based method with the aim to detect and
quantify the species included in the products labeled as Thunnus.
Different DNA extraction methods were assaye ...
[++]
One of most common frauds in the sale of tuna is the replacement of the species specified on the
label with others of lower quality and value. Therefore, the purpose of the present work was to
develop a fast, sensible and highly specificity DNA based method with the aim to detect and
quantify the species included in the products labeled as Thunnus.
Different DNA extraction methods were assayed. Attending to the sample quantity and quality,
in both fresh (T.alalunga, T.albacares y T.obesus) and canned products (T. albacares and
T.alalunga), the optimum results were obtained using a commercial kit (Wizard-DNA Clean-Up).
In order to detect the absence or presence of DNA of the studied species and to quantify it, primers
to amplify a sequence of the 16S-rDNA gene of Thunnus species and sequences of the control
region of the mitochondrial DNA of T.alalunga and T.albacares were selected. Different trials
were conducted with the aim to perform qualitative and quantitative PCR methods. For
quantitative PCR amplification, non-specific fluorochromes (Sybr Green) and specific probes
(TaqMan) were used. The results showed qualitative PCR amplification for the three primers
selected, allowing to determine the presence of the species studied. Regarding the quantitative
PCR, amplifications were obtained for the genus Thunnus and T.alalunga using Sybr Green.
However, T. albacares could not be detected using that method. In addition to Sybr Green, a
technique to quantify the 16S rDNA fragment using TaqMan probes has been developed,
obtaining as a result a higher specificity. [--]
Subject
qPCR,
PCR,
Thunnus alalunga,
Thunnus albacares
Degree
Graduado o Graduada en Innovación en Procesos y Productos Alimentarios por la Universidad Pública de Navarra /
Elikagai Prozesuen eta Produktuen Berrikuntzan Graduatua Nafarroako Unibertsitate Publikoan