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Puesta a punto de la metodología para la detección de alelos en los genes implicados en el color del caballo

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2024-07-01

Date

2019

Authors

Garmendia Antoñana, Nahiara

Publisher

Acceso abierto / Sarbide irekia
Trabajo Fin de Grado / Gradu Amaierako Lana

Project identifier

Abstract

El color de la capa es uno de los factores de importancia para la identificación racial equina. A su vez es un elemento muy influyente en el valor final del animal, afectando a su demanda e incluso determinando su función. Las leyes de la herencia juegan un papel fundamental en la obtención de equinos que muestren el color de capa deseado. Un paso previo a este cometido es la identificación genética del color de la capa. El presente estudio tiene como objetivo el desarrollo y puesta a punto de una técnica fiable, rápida y económica para la detección genotípica rutinaria de las mutaciones causantes de los diferentes colores de capa en las razas equinas ibéricas. Se realizó el genotipado simultáneo de siete genes (Grey, Extension, Agouti, Cream, Champagne, Pearl y Silver) a través de la técnica “Primer extension” o SNaPshot®. Para ello, se realizó una validación de cada uno de los genes por separado, una puesta a punto conjunta de todos los genes y por último una evaluación de la técnica en base a su repetibilidad. Las muestras de ADN tomadas como referencia se encuentran en dos soportes, y corresponden a 2 4 animales de tres razas ibéricas previamente genotioados por el laboratorio de diagnóstico genético de la Universidad de Córdoba. Se logró un 100% de exactitud en los resultados de genotipo obtenidos y un 100% de acuerdo entre los resultados obtenidos mediante el estudio de repetibilidad, lo que pone de manifiesto la robustez de la técnica.


The coat colour is one of the important factors for equine breed identification. In the same way, it is a very influential element of the animal final value, affecting its demand and even determining its occupation. The laws of inheritance play an essential role in obtaining horses that show the desired coat colour. A previous step to this purpose is the genetic identification of the coat colour. The aim of the present study is the development and optimization of a reliable, fast and inexpensive technique for the routine genotype detection of the mutations causing the different coat colours in Iberian equine breeds. The simultaneous genotyping of seven genes (Gray, Extension, Agouti, Cream, Champagne, Pearl and Silver) was carried out through the "Primer extension" or SNaPshot® technique. Therefore, a validation of each of the genes was carried out separately, subsequently a joint development of all these genes and finally an evaluation of the technique based on its repeatability. The samples of DNA taken as a reference are found in two supports and correspond to 2 4 animals from three Iberian breeds previously genotyped by the genetic diagnosis laboratory of the University of Córdoba. A 100% of accuracy was achieved in the genotype results obtained. Also, a 100% of agreement was obtained between the results through the repeatability study, which highlights the robustness of the technique.

Description

Keywords

Color de capa, Caballo, Genotipo, Mutación, SNaPshot, Coat colour, Genotype, Horse, SNaPshot, Mutation

Department

Faculty/School

Escuela Técnica Superior de Ingenieros Agrónomos / Nekazaritza Ingeniarien Goi Mailako Eskola Teknikoa

Degree

Graduado o Graduada en Innovación en Procesos y Productos Alimentarios por la Universidad Pública de Navarra, Elikagai Prozesuen eta Produktuen Berrikuntzan Graduatua Nafarroako Unibertsitate Publikoan

Doctorate program

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