Artículos de revista DEIO - EIOS Aldizkari artikuluak
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Publication Open Access Un nuevo algoritmo en programación signomial(Sociedad Española de Estadística e Investigación Operativa, 1992) Allueva, A.; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaLa técnica de programación geométrica resuelve problemas no lineales en los que tanto la función objetivo como las restricciones son expresiones posinomiales con coeficientes positivos. La teoría de programación signomial es similar para el caso en que los coeficientes sean reales arbitrarios. En este trabajo describimos un procedimiento de solución para problemas signomiales que pueden transformarse en problemas geométricos inversos. Este procedimiento incluye la formulación de un problema aumentado con grado de dificultad cero y el uso de la técnica de condensación de posinomiales. La solución del problema original precisa la estimación de un conjunto de parámetros del problema aumentado. Presentamos un procedimiento iterativo para la estimación de éstos y proponemos un nuevo algoritmo para resolver el modelo signomial.Publication Open Access Nuevo criterio de complejidad utilizando una medida de eficiencia(Instituto Nacional de Estadística, 1995) Munduate del Río, Arantza; Pérez Prados, Antonio; Cano Sevilla, Francisco J.; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaCentrado en el campo de los árboles de decisión, este trabajo estudia la forma de selección de un árbol óptimo entre los posibles árbo1es obtenidos a partir del análisis de un conjunto de datos, utilizando para ello una cantidad criterio que combina linealmente dos medidas de la calidad de un árbol: el error de resustitución y la eficiencia. Analizando el efecto de un proceso de poda en la cantidad criterio se obtiene una sucesión finita de subárboles rnínimos óptimamente podados del árbol máximo para los posibles valores del parámetro α de la combinación.Publication Open Access Criterio de selección de un árbol óptimo según coeficientes de asociación derivados de χ²(Universitat Politècnica de Catalunya, 1996) Cano Sevilla, Francisco J.; Munduate del Río, Arantza; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaSe analiza en primer lugar la variación que se produce en el valor del coeficiente de contingencia al realizarse un proceso de poda en un árbol de decisión T. Conocido este efecto, se define una cantidad criterio que combina linealmente el coeficiente de contingencia con el índice de simplicidad. A partir de esta cantidad criterio, se propone un método de obtención de un árbol óptimo para cada uno de los distintos valores del parámetro α de la combinación lineal. Para seleccionar el árbol óptimo entre todos ellos se utiliza el coeficiente de Tschuprow, dependiente de las dos medidas consideradas para la calidad del árbol.Publication Open Access Cálculo de la distribución del tiempo de vida de componentes mediante autopsia en sistemas binarios aditivos, serie-paralelo y paralelo-serie(Universitat Politècnica de Catalunya, 1997) Mallor Giménez, Fermín; Azcárate Camio, Cristina; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaEn este artículo se estudia el problema de determinar la función de distribución del tiempo de vida de las componentes de un sistema binario, a partir del conocimiento de las leyes que rigen el funcionamiento del sistema y del conjunto de componentes que causa su fallo (obtenida mediante autopsia del sistema en el momento de su deterioro). Se presentan los resultados de Meilijson (1981) y Nowik (1990) que proponen un sistema de ecuaciones impíıcito para obtener estas distribuciones. Sin embargo, se observa que este sistema es de muy difícil resolución práctica, por lo que nosotros consideramos un método cuya utilización es más restringida pero más sencilla, y estudiamos su aplicación a sistemas binarios aditivos, serie-paralelo y paralelo-serie.Publication Open Access Intensidade tecnológica e sistemas de trabalho de alto desempenho(Fundaçao Getulio Vargas, 2004) García Olaverri, Carmen; Larraza Kintana, Martín; Urtasun Alonso, Ainhoa; Gestión de Empresas; Enpresen Kudeaketa; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaThe paper examines the moderating effect that the technological intensity of the environment in which the firm operates exerts in the High Performance Work Systems (HPWS) - firm's operational performance relationship. We study this potential moderating effect in a sample of 593 Spanish manufacturing firms divided in two sub-samples of high (n1=301) and low (n2=292) technology firms. The results show that HPWS (positively) influence firm operational performance in the case of high-tech firms, while no effect is observed for low-tech firms.Publication Open Access Motor unit action potential duration, II: a new automatic measurement method based on the wavelet transform(Lippincott, Williams & Wilkins, 2007) Rodríguez Carreño, Ignacio; Gila Useros, Luis; Malanda Trigueros, Armando; García Gurtubay, Ignacio; Mallor Giménez, Fermín; Gómez Elvira, Sagrario; Rodríguez Falces, Javier; Navallas Irujo, Javier; Ingeniería Eléctrica y Electrónica; Estadística e Investigación Operativa; Ingeniaritza Elektrikoa eta Elektronikoa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaTo present and evaluate a new algorithm, based on the wavelet transform, for the automatic measurement of motor unit action potential (MUAP) duration. A total of 240 MUAPs were studied. The waveform of each MUAP was wavelet-transformed, and the start and end points were estimated by regarding the maxima and minima points in a particular scale of the wavelet transform. The results of the new method were compared with the gold standard of duration marker positions obtained by manual measurement. The new method was also compared with a conventional algorithm, which we had found to be best in a previous comparative study. To evaluate the new method against manual measurements, the dispersion of automatic and manual duration markers were analyzed in a set of 19 repeatedly recorded MUAPs. The differences between the new algorithm’s marker positions and the gold standard of duration marker positions were smaller than those observed with the conventional method. The dispersion of the new algorithm’s marker positions was slightly less than that of the manual one. Our new method for automatic measurement of MUAP duration is more accurate than other available algorithms and more consistent than manual measurements.Publication Open Access Motor unit action potential duration, I: variability of manual and automatic measurements(Lippincott, Williams & Wilkins, 2007) Rodríguez Carreño, Ignacio; Gila Useros, Luis; Malanda Trigueros, Armando; García Gurtubay, Ignacio; Mallor Giménez, Fermín; Gómez Elvira, Sagrario; Rodríguez Falces, Javier; Navallas Irujo, Javier; Ingeniería Eléctrica y Electrónica; Estadística e Investigación Operativa; Ingeniaritza Elektrikoa eta Elektronikoa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaTo analyze the variability in manual measurements of motor unit action potential (MUAP) duration and to evaluate the effectiveness of well-known algorithms for automatic measurement. Two electromyographists carried out three independent duration measurements of a set of 240 MUAPs. The intraexaminer and interexaminer variabilities were analyzed by means of the Gage Reproducibility and Repeatability method. The mean of the three closest manually marked positions was considered the gold standard of the duration markers positions (GSP). The results of four wellknown automatic methods for estimating MUAP duration were compared with the GSP. Manual measurements of duration showed a lot of variability, with the combined intraoperator and interoperator variability greater than 30%. The greatest difference between manual positions was 11.2 ms. The mean differences between the GSP and those obtained with the four automatic methods ranged between 0.6 and 8.5 ms. Both manual and automatic measurements of MUAP duration show a high degree of variability. More precise methods are needed to improve the accuracy and reliability of the estimates of this parameter.Publication Open Access A review of estimation of distribution algorithms in bioinformatics(BioMed Central, 2008) Armañanzas, Rubén; Inza, Iñaki; Santana, Roberto; Saeys, Yvan; Flores, Jose Luis; Lozano, Jose Antonio; Peer, Yves van de; Blanco Gómez, Rosa; Robles, Victor; Bielza, Concha; Larrañaga, Pedro; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaEvolutionary search algorithms have become an essential asset in the algorithmic toolbox for solving high-dimensional optimization problems in across a broad range of bioinformatics problems. Genetic algorithms, the most well-known and representative evolutionary search technique, have been the subject of the major part of such applications. Estimation of distribution algorithms (EDAs) offer a novel evolutionary paradigm that constitutes a natural and attractive alternative to genetic algorithms. They make use of a probabilistic model, learnt from the promising solutions, to guide the search process. In this paper, we set out a basic taxonomy of EDA techniques, underlining the nature and complexity of the probabilistic model of each EDA variant. We review a set of innovative works that make use of EDA techniques to solve challenging bioinformatics problems, emphasizing the EDA paradigm's potential for further research in this domain.Publication Open Access Accidente laboral. ACSOM una nueva orientación para gestión automática del riesgo(Gobierno de Navarra, 2009) García Felipe, Ana Isabel; Conte Soriano, Juan Carlos; Rubio Aranda, Encarnación; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaFundamento. Analizar la accidentalidad laboral en todo tipo de empresas, a través de los riesgos que la provocan, teniendo en cuenta que el objetivo final es establecer una clasificación de riesgos prioritarios. Esta información permite abordar las acciones preventivas oportunas sobre los riesgos más vulnerables. Material y Métodos. Se aplica un conjunto de técnicas estadístico-matemáticas, basadas fundamentalmente en contrastes estadísticos, a los accidentes laborales acaecidos durante tres años, en un organismo de investigación y desarrollo español (I+D) con 8.780 trabajadores. Se utiliza como patrón de referencia en este estudio, para un análisis comparativo, el conjunto de accidentes en España durante un periodo de 11 años. Resultados. Tras la aplicación de la nueva metodología, los dos primeros riesgos que requieren acciones preventivas prioritarias son interacción con substancias agresivas y accidentes con maquinaria móvil. Si únicamente se hubieran considerado los dos riesgos con frecuencias más elevadas, sin tener en cuenta la vulnerabilidad de cada uno de ellos, los riesgos prioritarios hubieran sido sobreesfuerzos y caídas al mismo nivel. Conclusiones. El análisis proporciona una relación de los riesgos más vulnerables (puntos débiles), sobre los cuales actuar y de esta forma ser más efectivos a la hora de reducir la accidentalidad.Publication Open Access Estimating unemployment in very small areas(Institut d'Estadística de Catalunya-IDESCAT, 2009) Ugarte Martínez, María Dolores; Goicoa Mangado, Tomás; Militino, Ana F.; Sagaseta López, M.; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaIn the last few years, European countries have shown a deep interest in applying small area techniques to produce reliable estimates at county level. However, the specificity of every European country and the heterogeneity of the available auxiliary information, make the use of a common methodology a very difficult task. In this study, the performance of several design-based, model-assisted, and model-based estimators using different auxiliary information for estimating unemployment at small area level is analyzed. The results are illustrated with data from Navarre, an autonomous region located at the north of Spain and divided into seven small areas. After discussing pros and cons of the different alternatives, a composite estimator is chosen, because of its good trade-off between bias and variance. Several methods for estimating the prediction error of the proposed estimator are also provided.Publication Open Access Modelo de regresión de Cox de la pérdida auditiva en trabajadores expuestos a ruido y fluidos de mecanizado o humos metálicos(Gobierno de Navarra, 2010) Conte Soriano, Juan Carlos; Domínguez, A.; García Felipe, Ana Isabel; Rubio Aranda, Encarnación; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaFundamento. Los trabajos sobre pérdida auditiva laboral se han centrado clásicamente en el estudio del ruido como causa principal. En la rama del metal es muy común la presencia de contaminantes físicos y químicos. En este artículo se analizan ambos junto con ciertos hábitos personales, con la finalidad de ver su influencia conjunta en la pérdida auditiva laboral. Material y métodos. Se analiza una muestra de 558 trabajadores mediante regresión de Cox con una finalidad explicativa. Se define el carácter de las relaciones causa- efecto existentes entre las variables consideradas, con respecto a tres situaciones: sano/alterado; recuperable/ no recuperable; sin caídas en conversacionales/ con caídas en conversacionales. Resultados. El análisis refleja que los fluidos de mecanizado, en presencia de ruido, retrasan la adquisición de los diversos grados de alteración auditiva; efecto contrario al que producen los humos metálicos, que adelantan la adquisición de dichos estadios. El hábito de fumar se reconoce como influyente en la adquisición de un trauma acústico inicial; la exposición a ruido extralaboral influye en la adquisición de un trauma acústico avanzado; y por otro lado, los equipos de protección auditiva son protectores del ruido pero no de la ototoxicidad de los humos metálicos. Conclusión. Se pone de manifiesto el efecto antagónico de los fluidos de mecanizado y el sinérgico de los humos metálicos frente al ruido, explicando la variación temporal en la evolución de la alteración auditiva, relacionada con estas atmósferas; se comprueba la influencia del tabaco y del ruido extralaboral, en la adquisición del trauma acústico.Publication Open Access Depletion of the heaviest stable N isotope is associated with NH4+/NH3 toxicity in NH4+-fed plants(BioMed Central, 2011) Ariz Arnedo, Idoia; Cruz, Cristina; Morán Juez, José Fernando; González Moro, María Begoña; García Olaverri, Carmen; González Murua, Carmen; Martins Loucao, María A.; Aparicio Tejo, Pedro María; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa; Estadística e Investigación Operativa; IdAB. Instituto de Agrobiotecnología / Agrobioteknologiako InstitutuaBackground: In plants, nitrate (NO3-) nutrition gives rise to a natural N isotopic signature (δ15N), which correlates with the δ15N of the N source. However, little is known about the relationship between the δ15N of the N source and the 14N/15N fractionation in plants under ammonium (NH4+) nutrition. When NH4 + is the major N source, the two forms, NH4 + and NH3, are present in the nutrient solution. There is a 1.025 thermodynamic isotope effect between NH3 (g) and NH4 + (aq) which drives to a different δ15N. Nine plant species with different NH4 +-sensitivities were cultured hydroponically with NO3 - or NH4 + as the sole N sources, and plant growth and δ15N were determined. Short-term NH4 +/NH3 uptake experiments at pH 6.0 and 9.0 (which favours NH3 form) were carried out in order to support and substantiate our hypothesis. N source fractionation throughout the whole plant was interpreted on the basis of the relative transport of NH4 + and NH3. Results: Several NO3 --fed plants were consistently enriched in 15N, whereas plants under NH4 + nutrition were depleted of 15N. It was shown that more sensitive plants to NH4 + toxicity were the most depleted in 15N. In parallel, N-deficient pea and spinach plants fed with 15NH4 + showed an increased level of NH3 uptake at alkaline pH that was related to the 15N depletion of the plant. Tolerant to NH4 + pea plants or sensitive spinach plants showed similar trend on 15N depletion while slight differences in the time kinetics were observed during the initial stages. The use of RbNO3 as control discarded that the differences observed arise from pH detrimental effects. Conclusions: This article proposes that the negative values of δ15N in NH4 +-fed plants are originated from NH3 uptake by plants. Moreover, this depletion of the heavier N isotope is proportional to the NH4 +/NH3 toxicity in plants species. Therefore, we hypothesise that the low affinity transport system for NH4 + may have two components: one that transports N in the molecular form and is associated with fractionation and another that transports N in the ionic form and is not associated with fractionation.Publication Open Access Adherence to the Mediterranean diet reduces mortality in the Spanish cohort of the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC-Spain)(Cambridge University Press, 2011) Buckland, Genevieve; Agudo, Antonio; Travier, Noemie; Huerta, José María; Cirera, Lluís; Tormo, María José; Navarro, Carmen; Chirlaque, María Dolores; Moreno Iribas, Conchi; Ardanaz, Eva; Barricarte Gurrea, Aurelio; Etxeberria Andueza, Jaione; Marín, Pilar; Quirós, J. Ramón; Redondo, María Luisa; Larrañaga, Nerea; Amiano, Pilar; Dorronsoro, Miren; Arriola, Larraitz; Basterretxea, Mikel; Sánchez, María José; Molina, Esther; González, Carlos A.; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa; Gobierno de Navarra / Nafarroako GobernuaEpidemiological studies show that adherence to a Mediterranean diet (MD) increases longevity; however, few studies are restricted to Mediterranean populations or explore the effect of a MD pattern that directly incorporates olive oil. Therefore the relationship between adherence to the MD and mortality was studied within the the Spanish cohort of the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC-Spain). The EPIC-Spain analysis included 40 622 participants (37·7% males) aged 29–69 years who were recruited from five Spanish regions in 1992–1996. During a mean follow-up of 13·4 years, 1855 deaths were documented: 913 from cancer, 399 from CVD, 425 from other causes and 118 from unknown causes of death. Risk of all-cause and cause-specific mortality was assessed according to the level of adherence to a relative MD (rMED) score, measured using an 18-unit scale incorporating nine selected dietary components. A high compared with a low rMED score was associated with a significant reduction in mortality from all causes (hazard ratio (HR) 0·79; 95% CI 0·69, 0·91), from CVD (HR 0·66; 95% CI 0·49, 0·89), but not from overall cancer (HR 0·92; 95% CI 0·75, 1·12). A 2-unit increase in rMED score was associated with a 6% (P,0·001) decreased risk of all-cause mortality. A high olive oil intake and moderate alcohol consumption contributed most to this association. In this Spanish cohort, following an olive oil-rich MD was related to a significant reduction in all-cause mortality, and reduced the risk of mortality from CVD. These results support the important role that the MD pattern has on reducing mortality in Mediterranean countries.Publication Open Access Characterization of genetic resources of onion (Allium cepa L.) from the Spanish secondary centre of diversity(Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA), 2011) Mallor Giménez, Cristina; Carravedo Fantova, Miguel; Estopañán Muñoz, Gloria; Mallor Giménez, Fermín; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaLa cebolla es el segundo cultivo hortícola a nivel mundial. Sin embargo, el conocimiento sobre los recursos y la diversidad genética de esta especie es limitado. Por ello, el objetivo del presente trabajo consistió en el estudio morfológico y físico-químico de una colección de 86 cultivares de cebolla procedentes de España (que forma parte del centro secundario de diversificación). Los caracteres evaluados en el bulbo incluyeron: peso, forma, firmeza, contenido en sólidos solubles (SSC), pungencia y contenido en azúcares (glucosa, fructosa y sacarosa). Los resultados evidenciaron una gran variabilidad en todos los caracteres evaluados. Las correlaciones fueron significativas entre la pungencia y SSC (r = 0,34), firmeza (r = 0,32) y contenido en sacarosa (r = 0,34); entre contenido en fructosa y glucosa (r = 0,79); entre contenido en sacarosa y SSC (r = 0,57); entre SSC y peso (r = –0,35); entre contenido en fructosa y sacarosa (r = –0,22) y entre el peso y contenido en sacarosa (r = –0,43). El análisis discriminante dio lugar a la formación de cuatro grupos con un ajuste del 95,3%. El grupo 1 está formado por bulbos grandes, firmes y picantes, el grupo 2 por cebollas grandes, suaves y dulces, el grupo 3 por cebollas pequeñas, picantes y con un alto SSC y el grupo 4 por bulbos de forma alargada. La variabilidad encontrada para caracteres de interés agronómico indica que este material podría ser utilizado en futuros programas de mejora genética de esta especie. Además, la agrupación de los cultivares contribuiría a localizar mejor el material vegetal de interés y las correlaciones halladas entre los caracteres evaluados a establecer una adecuada estrategia de selección.Publication Open Access Th17-related genes and celiac disease susceptibility(Public Library of Science, 2012) Medrano, Luz María; García Magariños, Manuel; Dema, Barbara; Espino, Laura; Maluenda, Carlos; Polanco, Isabel; Figueredo, María Ángeles; Fernández Arquero, Miguel; Núñez, Concepción; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaTh17 cells are known to be involved in several autoimmune or inflammatory diseases. In celiac disease (CD), recent studies suggest an implication of those cells in disease pathogenesis. We aimed at studying the role of genes relevant for the Th17 immune response in CD susceptibility. A total of 101 single nucleotide polymorphisms (SNPs), mainly selected to cover most of the variability present in 16 Th17-related genes (IL23R, RORC, IL6R, IL17A, IL17F, CCR6, IL6, JAK2, TNFSF15, IL23A, IL22, STAT3, TBX21, SOCS3, IL12RB1 and IL17RA), were genotyped in 735 CD patients and 549 ethnically matched healthy controls. Case-control comparisons for each SNP and for the haplotypes resulting from the SNPs studied in each gene were performed using chi-square tests. Gene-gene interactions were also evaluated following different methodological approaches. No significant results emerged after performing the appropriate statistical corrections. Our results seem to discard a relevant role of Th17 cells on CD risk.Publication Open Access Tendencias en las tasas de incidencia de cáncer colorrectal en Navarra en el periodo 1990-2005(Gobierno de Navarra, 2012) Etxeberria Andueza, Jaione; Ugarte Martínez, María Dolores; Barricarte Gurrea, Aurelio; Goicoa Mangado, Tomás; Moreno Iribas, Conchi; Azagra, M. J.; San Roman, E.; Burgui, Rosana; Militino, Ana F.; Ardanaz, Eva; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaFundamento. En España, se ha observado un aumento de la incidencia de cáncer colorrectal (CCR) en ambos sexos en los últimos años, posiblemente debido a las mejoras diagnósticas, a la occidentalización de la dieta y al empeoramiento de los niveles de obesidad entre otros. En este trabajo se han estudiado las tendencias de la incidencia de CCR en las diferentes áreas de salud de Navarra (norte de España) durante el período 1990-2005. Métodos. Para cada sexo y área, se obtuvieron las tendencias de las tasas de incidencia y los correspondientes intervalos de confianza mediante modelos de P-splines. Resultados. Se observa una tendencia creciente de la incidencia de CCR en la mayoría de las áreas para ambos sexos, siendo menos pronunciada en las mujeres que en los hombres. En la zona centro de Pamplona (la capital) se observa una tendencia decreciente para los hombres durante el período estudiado. Conclusiones. Para cambiar las tendencias crecientes observadas en la mayoría de las áreas de la provincia, la prevención primaria es la mejor estrategia. Sin embargo, adquirir estilos de vida saludables tiene resultados a largo plazo por lo que un programa de detección temprana serviría como estrategia de prevención a más corto plazo.Publication Open Access A comparison of two modes of data collection: using multidimensional analysis(CSIC, 2012) Abascal Fernández, Elena; Díaz de Rada Igúzquiza, Vidal; García Lautre, Ignacio; Landaluce, M. Isabel; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa; Sociología; SoziologiaLa investigación sobre comparación entre encuestas presenciales y telefónicas se ha reducido en los últimos años, concluyendo que los resultados son similares, pero los recientes desarrollos tecnológicos y cambios sociales han llevado a reabrir el debate. Además de los problemas relacionados con la falta de este equipamiento (o la dificultad para acceder a los que lo poseen como es el caso de los teléfonos móviles), es importante tener en cuenta también que la respuesta de una encuesta telefónica supone una situación social totalmente distinta a la respuesta de una encuesta en presencia del entrevistador. Ambas situaciones generan diferencias importantes entre las encuestas respondidas en presencia del entrevistador (cara a cara) y a través del teléfono. Se trata de un fenómeno que ha sido analizado por numerosas investigaciones, si bien la gran mayoría han llevado a cabo una comparación “variable a variable”, con las limitaciones propias del análisis uni y bivariante. En el presente trabajo adoptaremos una perspectiva diferente, considerando conjuntamente todas las variables del cuestionario. Utilizaremos, para ello, el Análisis de Correspondencias Múltiples sobre una investigación del CIS realizada en el año 2005 sobre las elecciones autonómicas de Galicia (estudio número 2.608).Publication Open Access Classical molecular tests using urine samples as a potential screening tool for human papillomavirus detection in human immunodeficiency virus-infected women(American Society for Microbiology, 2013) Muñoz Bobo, Marina; Camargo, Milena; Soto de León, Sara; Sánchez, Ricardo; Pineda Peña, Andrea; Pérez Prados, Antonio; Patarroyo, Manuel Elkin; Patarroyo, Manuel Alfonso; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaHuman papillomavirus (HPV) is the main risk factor associated with the development of cervical cancer (CC); however, there are other factors, such as immunosuppression caused by the human immunodeficiency virus (HIV), that favor progression of the illness. This study was thus aimed at evaluating the functionality of classical PCR-based molecular tests for the generic identification of HPV DNA (GP5 /GP6 , MY09/MY11, and pU1M/2R primers, individually or in combination) using cervical and urine samples from 194 HIV-positive women. Infected samples were tested with type-specific primers for six high-risk types (HPV-16, -18, -31, -33, -45, and -58) and two low-risk types (HPV-6 and -11). HPV infection prevalence rates were 70.1% for the cervical samples and 63.9% for the urine samples. HPV-16 was the most prevalent viral type in the cervical and urine samples, with higher rates of multiple infections than single infections detected in such samples. HPV DNA detection by PCR (mainly with the pU1M/2R primer set) in urine samples was positively associated with abnormal cytological findings (atypical squamous cells of undetermined significance/squamous intraepithelial lesions [ASCUS/SIL]). It was determined that the operative characteristics for detection of cytological abnormalities were similar for cervical and urine samples. This suggested using PCR for the detection of HPV DNA in urine samples as a potential screening strategy for CC prevention in future prevention and control programs along with currently implemented strategies for reducing the impact of the disease, i.e., urine samples are economical, are easy to collect, have wide acceptability among women, and have operative characteristics similar to those of cervical samples.Publication Open Access Human papillomavirus detection from human immunodeficiency virus-infected Colombian women’s paired urine and cervical samples(Public Library of Science, 2013) Muñoz Bobo, Marina; Camargo, Milena; Soto de León, Sara; Sánchez, Ricardo; Parra, Diana; Pineda Peña, Andrea; Sussmann, Otto; Pérez Prados, Antonio; Patarroyo, Manuel Elkin; Patarroyo, Manuel Alfonso; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaInfection, coinfection and type-specific human papillomavirus (HPV) distribution was evaluated in human immunodeficiency virus (HIV)-positive women from paired cervical and urine samples. Paired cervical and urine samples (n = 204) were taken from HIV-positive women for identifying HPV-DNA presence by using polymerase chain reaction (PCR) with three generic primer sets (GP5+/6+, MY09/11 and pU1M/2R). HPV-positive samples were typed for six high-risk HPV (HR-HPV) (HPV-16, -18, -31, -33, -45 and -58) and two low-risk (LR-HPV) (HPV-6/11) types. Agreement between paired sample results and diagnostic performance was evaluated. HPV infection prevalence was 70.6% in cervical and 63.2% in urine samples. HPV-16 was the most prevalent HPV type in both types of sample (66.7% in cervical samples and 62.0% in urine) followed by HPV-31(47.2%) in cervical samples and HPV-58 (35.7%) in urine samples. There was 55.4% coinfection (infection by more than one type of HPV) in cervical samples and 40.2% in urine samples. Abnormal Papanicolau smears were observed in 25.3% of the women, presenting significant association with HPV-DNA being identified in urine samples. There was poor agreement of cervical and urine sample results in generic and type-specific detection of HPV. Urine samples provided the best diagnosis when taking cytological findings as reference. In conclusion including urine samples could be a good strategy for ensuring adherence to screening programs aimed at reducing the impact of cervical cancer, since this sample is easy to obtain and showed good diagnostic performance.Publication Open Access Desigualdades socioeconómicas en la mortalidad en Pamplona y Logroño en el periodo 1996-2007(Gobierno de Navarra. Departamento de Salud, 2013) Izco Goñi, N.; Etxeberria Andueza, Jaione; Delfrade Osinaga, J.; Floristan, Y.; Moreno Iribas, Conchi; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa OperatiboaFundamento. Describir las desigualdades en mortalidad en Logroño y Pamplona, ciudades del norte de España, utilizando un indicador de privación socioeconómica por secciones censales. Métodos. Para geocodificar la residencia de los fallecidos en base a las unidades censales se utilizó la dirección postal del Boletín Estadístico de Defunción y en su defecto la del Padrón Municipal o Tarjeta Sanitaria. Las variables socioeconómicas que componen el índice de privación se obtuvieron del Censo de Población y Vivienda de 2001. Se agruparon las secciones censales por quintiles de menor a mayor privación socioeconómica y se calcularon tasas ajustadas para la mortalidad total y para una lista de causas por sexo, grupo de edad (0-64, ≥ 65) y quintil del índice de privación socioeconómico. Resultados. La comparación de la mortalidad de las zonas con menor privación socioeconómica respecto a zonas geográficas con mayor privación mostró en ambas ciudades una mayor mortalidad principalmente entre los hombres menores de 65 años. En este subgrupo se observó un gradiente positivo entre la mortalidad y el índice de privación. Las zonas situadas en el quintil de mayor privación alcanzaron un riesgo relativo (RR) de 1,61 (IC 95%, 1,33-1,92) en Pamplona y de 1,77 (IC 95%, 1,55-2,01) en Logroño. Las mujeres menores de 65 años mostraron un RR de 1,44 (IC 95%, 1,18-1,74) y de 1,48 (IC 95%, 1,10-1,95) en las zonas situadas en el quintil de mayor privación de Pamplona y Logroño, respectivamente. Conclusiones. El estudio evidenció desigualdades en mortalidad asociadas a la privación socioeconómica en las ciudades de Logroño y Pamplona. También mostró la utilidad de los indicadores socioeconómicos y de mortalidad a nivel de área pequeña para identificar desigualdades en salud
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