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Pérez Prados, Antonio

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https://academica-e.unavarra.es/handle/2454/49783

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Pérez Prados

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Antonio

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Estadística, Informática y Matemáticas

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Distribution patterns of infection with multiple types of human papillomaviruses and their association with risk factors
(Public Library of Science, 2011) Soto de León, Sara; Camargo, Milena; Sánchez, Ricardo; Muñoz Bobo, Marina; Pérez Prados, Antonio; Purroy Unanua, Antonio; Patarroyo, Manuel Elkin; Patarroyo, Manuel Alfonso; Matemáticas; Matematika
Background: Infection with multiple types of human papillomavirus (HPV) is one of the main risk factors associated with the development of cervical lesions. In this study, cervical samples collected from 1, 810 women with diverse sociocultural backgrounds, who attended to their cervical screening program in different geographical regions of Colombia, were examined for the presence of cervical lesions and HPV by Papanicolau testing and DNA PCR detection, respectively. Principal Findings: The negative binomial distribution model used in this study showed differences between the observed and expected values within some risk factor categories analyzed. Particularly in the case of single infection and coinfection with more than 4 HPV types, observed frequencies were smaller than expected, while the number of women infected with 2 to 4 viral types were higher than expected. Data analysis according to a negative binomial regression showed an increase in the risk of acquiring more HPV types in women who were of indigenous ethnicity (+37.8%), while this risk decreased in women who had given birth more than 4 times (-31.1%), or were of mestizo (-24.6%) or black (-40.9%) ethnicity. Conclusions: According to a theoretical probability distribution, the observed number of women having either a single infection or more than 4 viral types was smaller than expected, while for those infected with 2-4 HPV types it was larger than expected. Taking into account that this study showed a higher HPV coinfection rate in the indigenous ethnicity, the role of underlying factors should be assessed in detail in future studies.
Open Access
Persistence, clearance and reinfection regarding six high risk human papillomavirus types in Colombian women: a follow-up study
(BioMed Central, 2014) Soto de León, Sara; Río Ospina, Luisa del; Camargo, Milena; Sánchez, Ricardo; Moreno Pérez, Darwin Andrés; Pérez Prados, Antonio; Patarroyo, Manuel Elkin; Patarroyo, Manuel Alfonso; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
Background: The design of new healthcare schemes which involve using molecular HPV screening means that both persistence and clearance data regarding the most prevalent types of HR-HPV occurring in cities in Colombia must be ascertained. Methods: This study involved 219 HPV positive women in all of whom 6 types of HR-HPV had been molecularly identified and quantified; they were followed-up for 2 years. The Kaplan-Meier survival function was used for calculating the time taken for the clearance of each type of HPV. The role of a group of independent variables concerning the time taken until clearance was evaluated using a Cox proportional-hazards regression model or parametric (log-logistic) methods when necessary. Regarding viral load, the Wilcoxon rank-sum test was used for measuring the difference of medians for viral load for each type, according to the state of infection (cleared or persistent). The Kruskal-Wallis test was used for evaluating the change in the women's colposcopy findings at the start of follow-up and at the end of it (whether due to clearance or the end of the follow-up period). Results: It was found that HPV-18 and HPV-31 types had the lowest probability of becoming cleared (1.76 and 2.75 per 100 patients/month rate, respectively). Women from Colombian cities other than Bogota had a greater probability of being cleared if they had HPV-16 (HR 2.58: 1.51-4.4 95% CI) or HPV-58 (1.79 time ratio: 1.33-2.39 95% CI) infection. Regarding viral load, HPV-45-infected women having 1 x 10(6) to 9.99 x 10(9) viral copies had better clearance compared to those having greater viral loads (1.61 time ratio: 1.01-2.57 95% CI). Lower HPV-31 viral load values were associated with this type's persistence and changes in colposcopy findings for HPV-16 gave the worst prognosis in women having low absolute load values. Conclusions: HPV infection clearance in this study was related to factors such as infection type, viral load and the characteristics of the cities from which the women came. Low viral load values would indicate viral persistence and a worse prognosis regarding a change in colposcopy findings.
Open Access
Cálculo de la distribución del tiempo de vida de componentes mediante autopsia en sistemas binarios aditivos, serie-paralelo y paralelo-serie
(Universitat Politècnica de Catalunya, 1997) Mallor Giménez, Fermín; Azcárate Camio, Cristina; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
En este artículo se estudia el problema de determinar la función de distribución del tiempo de vida de las componentes de un sistema binario, a partir del conocimiento de las leyes que rigen el funcionamiento del sistema y del conjunto de componentes que causa su fallo (obtenida mediante autopsia del sistema en el momento de su deterioro). Se presentan los resultados de Meilijson (1981) y Nowik (1990) que proponen un sistema de ecuaciones impíıcito para obtener estas distribuciones. Sin embargo, se observa que este sistema es de muy difícil resolución práctica, por lo que nosotros consideramos un método cuya utilización es más restringida pero más sencilla, y estudiamos su aplicación a sistemas binarios aditivos, serie-paralelo y paralelo-serie.
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The DNA load of six high-risk human papillomavirus types and its association with cervical lesions
(BioMed Central, 2015) Río Ospina, Luisa del; Soto de León, Sara; Camargo, Milena; Moreno Pérez, Darwin Andrés; Sánchez, Ricardo; Pérez Prados, Antonio; Patarroyo, Manuel Elkin; Patarroyo, Manuel Alfonso; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
Background: Analysing human papillomavirus (HPV) viral load is important in determining the risk of developing cervical cancer (CC); most knowledge to date regarding HPV viral load and cervical lesions has been related to HPV-16. This study evaluated the association between the viral load of the six most prevalent high-risk viral types in Colombia and cervical intraepithelial neoplasia (CIN) frequency. Methods: 114 women without CIN and 59 women having CIN confirmed by colposcopy, all of them positive by conventional PCR for HPV infection in the initial screening, were included in the study. Samples were tested for six high-risk HPV types to determine viral copy number by real-time PCR. Crude and adjusted odds ratios (ORa) were estimated for evaluating the association between each viral type's DNA load and the risk of cervical lesions occurring. Results: The highest viral loads were identified for HPV-33 in CIN patients and for HPV-31 in patients without lesions (9.33 HPV copies, 2.95 interquartile range (IQR); 9.41 HPV copies, 2.58 IQR). Lesions were more frequent in HPV-16 patients having a low viral load (3.53 ORa, 1.16-10.74 95%CI) compared to those having high HPV-16 load (2.62 ORa, 1.08-6.35 95%CI). High viral load in HPV-31 patients was associated with lower CIN frequency (0.34 ORa, 0.15-0.78 95%CI). Conclusions: An association between HPV DNA load and CIN frequency was seen to be type-specific and may have depended on the duration of infection. This analysis has provided information for understanding the effect of HPV DNA load on cervical lesion development.
Open Access
Human papillomavirus detection in women with and without human immunodeficiency virus infection in Colombia
(BioMed Central, 2014) Camargo, Milena; Soto de León, Sara; Muñoz Bobo, Marina; Sánchez, Ricardo; Peña-Herrera, Diego; Pineda Peña, Andrea; Sussmann, Otto; Paez, Carol; Pérez Prados, Antonio; Patarroyo, Manuel Elkin; Patarroyo, Manuel Alfonso; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
Background: HIV infection leads to a decreasing immune response, thereby facilitating the appearance of other infections, one of the most important ones being HPV. However, studies are needed for determining associations between immunodeficiency caused by HIV and/or the presence of HPV during the course of cervical lesions and their degree of malignancy. This study describes the cytological findings revealed by the Papanicolaou test, laboratory characteristics and HPV molecular profile in women with and without HIV infection. Methods: A total of 216 HIV-positive and 1,159 HIV-negative women were invited to participate in the study; PCR was used for the molecular detection of HPV in cervical samples. Statistical analysis (such as percentages, Chi-square test and Fisher's exact test when applicable) determined human papillomavirus (HPV) infection frequency (single and multiple) and the distribution of six types of high-risk-HPV in women with and without HIV infection. Likewise, a logistic regression model was run to evaluate the relationship between HIV-HPV infection and different risk factors. Results: An association was found between the frequency of HPV infection and infection involving 2 or more HPV types (also known as multiple HPV infection) in HIV-positive women (69.0% and 54.2%, respectively); such frequency was greater than that found in HIV-negative women (44.3% and 22.7%, respectively). Statistically significant differences were observed between both groups (p = 0.001) regarding HPV presence (both in infection and multiple HPV infection). HPV-16 was the most prevalent type in the population being studied (p = 0.001); other viral types had variable distribution in both groups (HIV-positive and HIV-negative). HPV detection was associated with <500 cell/mm(3) CD4-count (p = 0.004) and higher HIV-viral-load (p = 0.001). HPV-DNA detection, <200 cell/mm(3) CD4-count (p = 0.001), and higher HIV-viral-load (p = 0.001) were associated with abnormal cytological findings. Conclusions: The HIV-1 positive population in this study had high multiple HPV infection prevalence. The results for this population group also suggested a greater association between HPV-DNA presence and cytological findings. HPV detection, together with low CD4 count, could represent useful tools for identifying HIV-positive women at risk of developing cervical lesions.
Open Access
Un nuevo algoritmo en programación signomial
(Sociedad Española de Estadística e Investigación Operativa, 1992) Allueva, A.; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
La técnica de programación geométrica resuelve problemas no lineales en los que tanto la función objetivo como las restricciones son expresiones posinomiales con coeficientes positivos. La teoría de programación signomial es similar para el caso en que los coeficientes sean reales arbitrarios. En este trabajo describimos un procedimiento de solución para problemas signomiales que pueden transformarse en problemas geométricos inversos. Este procedimiento incluye la formulación de un problema aumentado con grado de dificultad cero y el uso de la técnica de condensación de posinomiales. La solución del problema original precisa la estimación de un conjunto de parámetros del problema aumentado. Presentamos un procedimiento iterativo para la estimación de éstos y proponemos un nuevo algoritmo para resolver el modelo signomial.
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Nuevo criterio de complejidad utilizando una medida de eficiencia
(Instituto Nacional de Estadística, 1995) Munduate del Río, Arantza; Pérez Prados, Antonio; Cano Sevilla, Francisco J.; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
Centrado en el campo de los árboles de decisión, este trabajo estudia la forma de selección de un árbol óptimo entre los posibles árbo1es obtenidos a partir del análisis de un conjunto de datos, utilizando para ello una cantidad criterio que combina linealmente dos medidas de la calidad de un árbol: el error de resustitución y la eficiencia. Analizando el efecto de un proceso de poda en la cantidad criterio se obtiene una sucesión finita de subárboles rnínimos óptimamente podados del árbol máximo para los posibles valores del parámetro α de la combinación.
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Accidente laboral. ACSOM una nueva orientación para gestión automática del riesgo
(Gobierno de Navarra, 2009) García Felipe, Ana Isabel; Conte Soriano, Juan Carlos; Rubio Aranda, Encarnación; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
Fundamento. Analizar la accidentalidad laboral en todo tipo de empresas, a través de los riesgos que la provocan, teniendo en cuenta que el objetivo final es establecer una clasificación de riesgos prioritarios. Esta información permite abordar las acciones preventivas oportunas sobre los riesgos más vulnerables. Material y Métodos. Se aplica un conjunto de técnicas estadístico-matemáticas, basadas fundamentalmente en contrastes estadísticos, a los accidentes laborales acaecidos durante tres años, en un organismo de investigación y desarrollo español (I+D) con 8.780 trabajadores. Se utiliza como patrón de referencia en este estudio, para un análisis comparativo, el conjunto de accidentes en España durante un periodo de 11 años. Resultados. Tras la aplicación de la nueva metodología, los dos primeros riesgos que requieren acciones preventivas prioritarias son interacción con substancias agresivas y accidentes con maquinaria móvil. Si únicamente se hubieran considerado los dos riesgos con frecuencias más elevadas, sin tener en cuenta la vulnerabilidad de cada uno de ellos, los riesgos prioritarios hubieran sido sobreesfuerzos y caídas al mismo nivel. Conclusiones. El análisis proporciona una relación de los riesgos más vulnerables (puntos débiles), sobre los cuales actuar y de esta forma ser más efectivos a la hora de reducir la accidentalidad.
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Criterio de selección de un árbol óptimo según coeficientes de asociación derivados de χ²
(Universitat Politècnica de Catalunya, 1996) Cano Sevilla, Francisco J.; Munduate del Río, Arantza; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
Se analiza en primer lugar la variación que se produce en el valor del coeficiente de contingencia al realizarse un proceso de poda en un árbol de decisión T. Conocido este efecto, se define una cantidad criterio que combina linealmente el coeficiente de contingencia con el índice de simplicidad. A partir de esta cantidad criterio, se propone un método de obtención de un árbol óptimo para cada uno de los distintos valores del parámetro α de la combinación lineal. Para seleccionar el árbol óptimo entre todos ellos se utiliza el coeficiente de Tschuprow, dependiente de las dos medidas consideradas para la calidad del árbol.
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Modelo de regresión de Cox de la pérdida auditiva en trabajadores expuestos a ruido y fluidos de mecanizado o humos metálicos
(Gobierno de Navarra, 2010) Conte Soriano, Juan Carlos; Domínguez, A.; García Felipe, Ana Isabel; Rubio Aranda, Encarnación; Pérez Prados, Antonio; Estadística e Investigación Operativa; Estatistika eta Ikerketa Operatiboa
Fundamento. Los trabajos sobre pérdida auditiva laboral se han centrado clásicamente en el estudio del ruido como causa principal. En la rama del metal es muy común la presencia de contaminantes físicos y químicos. En este artículo se analizan ambos junto con ciertos hábitos personales, con la finalidad de ver su influencia conjunta en la pérdida auditiva laboral. Material y métodos. Se analiza una muestra de 558 trabajadores mediante regresión de Cox con una finalidad explicativa. Se define el carácter de las relaciones causa- efecto existentes entre las variables consideradas, con respecto a tres situaciones: sano/alterado; recuperable/ no recuperable; sin caídas en conversacionales/ con caídas en conversacionales. Resultados. El análisis refleja que los fluidos de mecanizado, en presencia de ruido, retrasan la adquisición de los diversos grados de alteración auditiva; efecto contrario al que producen los humos metálicos, que adelantan la adquisición de dichos estadios. El hábito de fumar se reconoce como influyente en la adquisición de un trauma acústico inicial; la exposición a ruido extralaboral influye en la adquisición de un trauma acústico avanzado; y por otro lado, los equipos de protección auditiva son protectores del ruido pero no de la ototoxicidad de los humos metálicos. Conclusión. Se pone de manifiesto el efecto antagónico de los fluidos de mecanizado y el sinérgico de los humos metálicos frente al ruido, explicando la variación temporal en la evolución de la alteración auditiva, relacionada con estas atmósferas; se comprueba la influencia del tabaco y del ruido extralaboral, en la adquisición del trauma acústico.