Abstract
Gracias a la infraestructura presente en la Unidad de Proteómica de Navarrabiomed en
la que hay presentes máquinas como el espectrómetro de masas Triple TOF 5600
acoplado a un cromatógrafo líquido de alta resolución (HPLC), se han podido llevar a
cabo los flujos de trabajo explicados en esta memoria. Los experimentos de
proteómica realizados en esta unidad persiguen la identificación y cuanti ...
[++]
Gracias a la infraestructura presente en la Unidad de Proteómica de Navarrabiomed en
la que hay presentes máquinas como el espectrómetro de masas Triple TOF 5600
acoplado a un cromatógrafo líquido de alta resolución (HPLC), se han podido llevar a
cabo los flujos de trabajo explicados en esta memoria. Los experimentos de
proteómica realizados en esta unidad persiguen la identificación y cuantificación de
proteínas entre dos o más condiciones experimentales y caracterizar aquellas que sean
diferenciales en base a su cuantificación relativa. Esto permite por ejemplo cuantificar
las diferencias entre sujetos sanos y sujetos con afecciones o ver las diferencias de
expresión entre células estimuladas con un tratamiento y sin tratar.
Además veremos cómo no todos los programas diseñados para el análisis de los datos
obtenidos por estas técnicas se comportan igual y decidiremos cuales son más
eficientes en nuestro caso concreto y para el espectrómetro de masas Triple TOF 5600.
De igual modo propondremos flujos de análisis bioinformáticos para extraer la
información contenida en los experimentos de tipo diferencial, ya sea con R o Python.
La metodología desarrollada se utiliza hoy en día de manera rutinaria para analizar los
datos de la Unidad de Proteómica y ha sido empleada con éxito en varias publicaciones
científicas como son las presentes en el anexo 1. [--]
Degree
Máster Universitario en Ingeniería Biomédica /
Unibertsitate Masterra Ingeniaritza Biomedikoan
