Optimización del análisis de datos proteómicos procedentes del espectrómetro de masas Triple TOF 5600

Martínez de Morentin Iribarren, Xabier

Publication:
Optimización del análisis de datos proteómicos procedentes del espectrómetro de masas Triple TOF 5600

dc.contributor.advisorTFE	Rodríguez Falces, Javier
dc.contributor.advisorTFE	Fernández Irigoyen, Joaquín
dc.contributor.affiliation	Escuela Técnica Superior de Ingenieros Industriales y de Telecomunicación	es_ES
dc.contributor.affiliation	Telekomunikazio eta Industria Ingeniarien Goi Mailako Eskola Teknikoa	eu
dc.contributor.author	Martínez de Morentin Iribarren, Xabier
dc.date.accessioned	2016-11-22T14:00:13Z
dc.date.available	2017-09-29T23:00:14Z
dc.date.issued	2016
dc.date.updated	2016-11-17T10:30:36Z
dc.description.abstract	Gracias a la infraestructura presente en la Unidad de Proteómica de Navarrabiomed en la que hay presentes máquinas como el espectrómetro de masas Triple TOF 5600 acoplado a un cromatógrafo líquido de alta resolución (HPLC), se han podido llevar a cabo los flujos de trabajo explicados en esta memoria. Los experimentos de proteómica realizados en esta unidad persiguen la identificación y cuantificación de proteínas entre dos o más condiciones experimentales y caracterizar aquellas que sean diferenciales en base a su cuantificación relativa. Esto permite por ejemplo cuantificar las diferencias entre sujetos sanos y sujetos con afecciones o ver las diferencias de expresión entre células estimuladas con un tratamiento y sin tratar. Además veremos cómo no todos los programas diseñados para el análisis de los datos obtenidos por estas técnicas se comportan igual y decidiremos cuales son más eficientes en nuestro caso concreto y para el espectrómetro de masas Triple TOF 5600. De igual modo propondremos flujos de análisis bioinformáticos para extraer la información contenida en los experimentos de tipo diferencial, ya sea con R o Python. La metodología desarrollada se utiliza hoy en día de manera rutinaria para analizar los datos de la Unidad de Proteómica y ha sido empleada con éxito en varias publicaciones científicas como son las presentes en el anexo 1.	es_ES
dc.description.degree	Máster Universitario en Ingeniería Biomédica por la Universidad Pública de Navarra	es_ES
dc.description.degree	Ingeniaritza Biomedikoko Unibertsitate Masterra Nafarroako Unibertsitate Publikoan	eu
dc.embargo.inicio	2016-11-22
dc.embargo.lift	2017-03-01
dc.embargo.terms	2017-03-01
dc.format.mimetype	application/pdf	en
dc.identifier.uri	https://academica-e.unavarra.es/handle/2454/22741
dc.language.iso	spa	en
dc.rights.accessRights	info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.subject	Proteómica	es_ES
dc.subject	Espectrometría de masas	es_ES
dc.subject	Triple TOF 5600	es_ES
dc.subject	Label-free	es_ES
dc.subject	MaxQuant	es_ES
dc.title	Optimización del análisis de datos proteómicos procedentes del espectrómetro de masas Triple TOF 5600	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/masterThesis
dspace.entity.type	Publication