Estudio del impacto del mensajero secundario bacteriano c-di-GMP en las interacciones proteína-proteína
| dc.contributor.advisorTFE | Solano Goñi, Cristina | |
| dc.contributor.affiliation | Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y Biociencias | es_ES |
| dc.contributor.affiliation | Nekazaritzako Ingeniaritzako eta Biozientzietako Goi Mailako Eskola Teknikoa | eu |
| dc.contributor.author | Olagüe Negredo, Izaskun | |
| dc.date.accessioned | 2025-10-10T08:20:24Z | |
| dc.date.issued | 2025 | |
| dc.date.updated | 2025-10-07T10:06:15Z | |
| dc.description.abstract | El dinucleótido cíclico c-di-GMP es un mensajero secundario clave en bacterias, implicado en la regulación de diversos procesos fisiológicos como la transición entre estados móviles y sésiles, la formación de biofilms, la diferenciación celular o la adhesión a superficies. Su concentración intracelular está controlada por diguanilato ciclasas (DGCs), que lo sintetizan a través de un dominio GGDEF, y por fosfodiesterasas (PDEs), que lo degradan mediante dominios EAL o HD-GYP. Además de sus funciones catalíticas, se ha evidenciado que estas enzimas pueden participar directamente en interacciones proteína-proteína, actuando como reguladores específicos, y que estas interacciones pueden depender de los niveles intracelulares de c-di-GMP. El presente trabajo ha tenido como objetivo diseñar un sistema experimental para evaluar si un aumento en los niveles intracelulares de c-di-GMP influye en la interacción entre proteínas, utilizando el sistema de doble híbrido BACTH (Bacterial Adenylate Cyclase Two-Hybrid). Para ello, se empleó la cepa Escherichia coli BTH101, estándar en este tipo de ensayos. Tras determinar que la cepa BTH101 presenta niveles intracelulares de c-diGMP bajos, se construyó un plásmido compatible con el sistema BACTH que permite la expresión del gen hmsT, el cual codifica una DGC de Yersinia pestis, con el fin de aumentar los niveles intracelulares de c-di-GMP en la bacteria. A pesar de que se logró un incremento en los niveles del mensajero, se observó una notable heterogeneidad en BTH101 que expresa hmsT. Finalmente, se evaluó la funcionalidad del plásmido construido en el contexto del sistema BACTH, observando que el aumento de c-di-GMP afecta a la interacción homodimérica de la fosfodiesterasa PdeR de Salmonella Enteritidis, lo que respalda el papel regulador del mensajero en las interacciones proteínaproteína. | es_ES |
| dc.description.abstract | The cyclic dinucleotide c-di-GMP is a key second messenger in bacteria, involved in the regulation of various physiological processes such as the transition between motile and sessile states, biofilm formation, cell differentiation, and surface adhesion. Its intracellular concentration is controlled by diguanylate cyclases (DGCs), that harbour a GGDEF domain, and phosphodiesterases (PDEs), which degrade it via EAL or HD-GYP domains. In addition to their catalytic functions, these enzymes have also been shown to act as effector proteins, engaged in direct protein–protein interactions that are sometimes dependent on intracellular c-di-GMP levels. This work aimed to design an experimental system to study whether increased intracellular levels of c-di-GMP affect protein–protein interactions, using the BACTH system (Bacterial Adenylate Cyclase Two-Hybrid). The Escherichia coli strain BTH101, standard in this assay, was employed. After finding that endogenous c-di-GMP levels in the E. coli BACTH strain were low, a BACTHcompatible plasmid was constructed by which hmsT, a gene that encodes a DGC from Yersinia pestis, is expressed to drive constitutive c-di-GMP synthesis. Although an increase in c-di-GMP levels was achieved, a marked phenotypic heterogeneity was observed among BTH101 expressing hmsT. Finally, the functionality of this plasmid was assessed within the BACTH system, revealing that elevated c-di-GMP levels affect the homodimeric interaction of the phosphodiesterase PdeR from Salmonella Enteritidis, supporting the regulatory role of this messenger in protein–protein interactions. | en |
| dc.description.degree | Graduado o Graduada en Biotecnología por la Universidad Pública de Navarra | es_ES |
| dc.description.degree | Bioteknologiako Graduatua Nafarroako Unibertsitate Publikoan | eu |
| dc.embargo.lift | 2027-07-01 | |
| dc.embargo.terms | 2027-07-01 | |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier.uri | https://academica-e.unavarra.es/handle/2454/55250 | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.rights.accessRights | info:eu-repo/semantics/embargoedAccess | |
| dc.subject | c-di-GMP | es_ES |
| dc.subject | Diguanilato ciclasa (DGC) | es_ES |
| dc.subject | Sistema BACTH | es_ES |
| dc.subject | Escherichia coli BTH101 | es_ES |
| dc.subject | hmsT | es_ES |
| dc.subject | PdeR | es_ES |
| dc.subject | c-di-GMP | en |
| dc.subject | Diguanylate cyclase (DGC) | en |
| dc.subject | BACTH system | en |
| dc.subject | Escherichia coli BTH101 | en |
| dc.subject | hmsT | en |
| dc.subject | PdeR | en |
| dc.title | Estudio del impacto del mensajero secundario bacteriano c-di-GMP en las interacciones proteína-proteína | es_ES |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/bachelorThesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| relation.isAdvisorTFEOfPublication | b6a392a0-c0e5-4c6f-9086-6fa4291d0856 | |
| relation.isAdvisorTFEOfPublication.latestForDiscovery | b6a392a0-c0e5-4c6f-9086-6fa4291d0856 |