Dual-histidin kinasas en hongos basidiomicetos

Abstract

La genómica comparativa está emergiendo como una potente herramienta para mejorar el conocimiento de la biología de hongos y, en consecuencia, avanzar en sus posibles aplicaciones biotecnológicas. El sistema modelo a utilizar en este Trabajo Fin de Máster son los hongos basidiomicetos que están secuenciados completamente. El objetivo general es abordar el análisis del genoma de estos hongos mediante la comparación con los genomas completos de hongos basidiomicetos disponibles con diferentes estilos de vida. Este estudio de genómica comparativa se dirige al análisis de los sistemas reguladores de dos componentes. Las proteínas de los sistemas de dos componentes (Two-component system, TCS) son componentes de transducción de señales complejas en hongos y tienen un papel esencial en la regulación de diferentes funciones y respuestas celulares. Las especies de hongos basidiomicetos presentan una gran variación en cuanto a sus características fisiológicas, complejidad morfológica y tipo de vida. Algunas proteínas de los sistemas de dos componentes están muy conservadas entre todas las especies de hongos basidiomicetos, mientras que otras parecen ser propias de algunas especies particulares. Además algunas especies parecen haber desarrollado un único grupo de histidin kinasas (HK) con una arquitectura de dominios inusual, las dual-HKs. La presencia de diferentes grupos de proteínas TCS entre los basidiomicetos puede reflejar su adaptación a diferentes nichos. Las dual-histidin kinasas son HKs híbridas complejas que contienen en un polipéptido sencillo dos módulos transmisores (T) y dos dominios reguladores de respuesta (R) que se combinan en una geometría TRTR. En hongos, esta familia de proteínas está limitada a algunas especies particulares del phylum Basidiomycota, y ausentes del resto de phyla. Este estudio extiende la investigación de las dual-HKs a 80 genomas de hongos basidiomicetos secuenciados totalmente, analizando su distribución, arquitectura de dominios y relaciones filogenéticas. Además de los hongos basidiomicetos, se han encontrado algunas especies de bacterias que contienen HKs híbridas con una arquitectura de dominios TRTR codificadas en un único gen.